区别在于：高新技术企业是指在《国家重点支持的高新技术领域》内，持续进行研究开发与技术成果转化，形成企业核心自主知识产权，并以此为基础开展经营活动，在中国境内(不包括港、澳、台地区)注册一年以上的居民企业。它是知识密集、技术密集的经济实体。 而国家级重点高新技术企业原则上每年认定一次，在以上的基础上还要满足下面的条件 ：

(一)经省认定的高新技术企业，且自认定后的运营期在一年以上;

(二)已承担国家级火炬计划项目，企业主导产品的技术水平在国内处于领先地位。企业在本行业中有较大影响，对行业技术进步有促进和带动作用;

(三)年销售收入逾亿元(软件企业除外)，且其中60%以上为高新技术产品销售收入。人均销售收入20万元以上;

(四)企业领导班子科技意识强。企业整体研究开发(R&D)和技术创新能力较强，每年R&D投入不低于当年总销售额的5%。具有大专以上学历的科技人员占企业职工总数的30%以上，其中从事高新技术产品研究开发的科技人员占企业职工总数的10%以上;

(五)企业管理科学、规范;

(六)重视人才(包括科技开发、市场营销、企业管理等方面人才培养，并有长期培养计划;

(七)企业认真制订了发展规划。